苯基色譜柱具有苯基官能團π電子色譜柱。對諸如芳香族化合物分離，除疏水性相互作用外，還有固定相和溶質之間π-π電子間相互作用的幫助，因此顯示出不同于包含ODS在內的烷基硅膠基質固定相的分離特性。
可以提供互補的分離選擇性，特別適合于帶有芳香環的化合物分離。雜化顆粒技術與色譜柱的結合，使該固定相具有很好的pH穩定性、優化的表面覆蓋率、對所有類型化合物的優異色譜峰形，以及高重現性的保留時間。此外，雙點鍵合的短鏈苯基配體還提高了低pH條件下鍵合相的耐水解穩定性。填料基質與配體技術的*結合為復雜混合物的分離提供了又一個選擇性調節的新工具。
苯基色譜柱不能用純水沖洗的原因有以下幾點：
先是色譜柱的方向問題。大多數色譜柱會標明方向。這個大家都知道，安裝的時候要順著方向安裝。不過也有一些色譜柱沒有方向，這些是雙相填料的色譜柱。第一次使用時的方向就是它的方向。不過所有的色譜柱都是，一旦開始使用，就不要轉換方向。這樣會損毀色譜柱。
然后是柱壓問題。一般的色譜柱壓力不要超過20MPa，壓力過高會加速損毀色譜柱。
接著是柱溫。色譜柱溫度不要超過45℃。也是會加速損毀色譜柱。
還有pH值。色譜柱的pH值范圍是不同的。大多數色譜柱的pH值范圍是4-7左右。有些偏向酸性，有些偏向堿性的，還有一些pH值廣泛的。這些按照說明書操作即可。
除此之外，色譜柱還有別的一些需要注意的事情。
